Материалы и методы исследования
Страница 2

Определение уровня генетической изменчивости проводили на основе ряда общепринятых показателей: среднее число аллелей на локус (А), полиморфность (Р) и ожидаемая гетерозиготность (Не). Для расчета ожидаемой гетерозиготности Не по каждому локусу использовали формулу

,

где хi – частота i-того аллеля. Показатель средней ожидаемой гетерозиготности вычислялся как

,

где Hj – гетерозиготность j-того локуса, К– количество исследованных локусов. Показатель полиморфности (Р) рассчитывали путем деления числа полиморфных локусов на общее количество исследованных локусов, а параметр среднего числа аллелей на локус (А) путем деления количества выявленных аллелей на общее количество исследованных локусов. Полиморфность подсчитывалась по 99% критерию (частота наиболее общего аллеля не превышала 99%), а среднее число аллелей на локус по всем обнаруженным.

Для оценки генетической дифференциации среди таксонов лиственниц использовался коэффициент генетической дистанции Неи (DN), который учитывает различия в аллельных частотах всех проанализированных локусов:

DN= - ln IN ,

где xij и yij — частоты i-го аллеля j-го локуса сравниваемых таксонов. Если DN равно 0, то таксоны идентичны. Чем больше значение DN, тем менее они родственны.

Считается, что коэффициент дистанции Неи самый точный, и поэтому он используется практически всеми исследователями. Дендрограмма наглядно демонстрирующая общую картину генетических взаимоотношений между исследованными таксонами на основании полученных коэффициентов DN строились методом невзвешенного парно-группового кластерного анализа (UPGMA) (Sneath, Sokal 1973).

Страницы: 1 2 


Интересное на сайте:

Пространство и время (классическая механика И. Ньютона и теория относительности А. Эйнштейна)
Пространство и время в классической механике И. Ньютона В 1687 г. вышел основополагающий труд Ньютона «Математические начала натуральной философии». Этот труд более чем на два столетия определил развитие всей естественно-научной картины ...

Семейство саламандровые — salamandridae
Одно из эволюционно продвинутых семейств. Объединяет тритонов и саламандр, ведущих полностью водный, полуводный или наземный образ жизни. Размеры животных, как правило, небольшие. Общая длина менее 35 см. Окрашены разнообразно, некоторые ...

Пищевод. Строение пищевода
Пищевод (esophagus) представляет собой мышечную трубку длиной около 25см. Различают 3 части пищевода – шейную, грудную и брюшную. Шейная часть без резких границ начинается от глотки на уровне VI шейного позвонка, проходит позади гортани и ...